Если вы удалили или перенесли каталог /var/www/local/htdocs_ci, то для его восстановления нужно:
1. Снова создать каталог /var/www/local/htdocs_ci , если он был удален.
2. Выполнить полную перезагрузку.
3. При загрузке сервера, сразу после таблицы BIOS нажимайте раз в секунду клавиши вверх вниз, до появления menu
4. Выберите ядро ICServer и напишите
recover=1
Например, ICServer recover=1
После этого стандартное содержимое каталога будет восстановленo.
Рекомендации по редактированию описаны здесь.